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La Maestría en Estudios Regionales fue creada en 1985. Desde sus inicios ha tenido el interés de formar especialistas que atiendan problemáticas sociales desde la perspectiva territorial. Esto es, entender el territorio no como un simple espacio donde transcurren los hechos, sino como una unidad de análisis. La valiosa colaboración de distintos centros de investigación ha enriquecido la docencia del posgrado.
El programa cuenta con distintas líneas de investigación:
i) redes de política pública y gobiernos locales,
ii) democracia, ciudadanía y gobernabilidad en los planos local y regional,
iii) territorio y cultura: transformaciones, usos y apropiaciones del espacio e,
iv) historia regional.
El programa que imparte el Instituto Mora forma parte del Padrón Nacional de Posgrado CONACyT, inscrito en la categoría de "Competencia internacional”.