​​​El Instituto de Investigaciones Dr. José María Luis Mora es un centro de alto nivel académico y científico que se ha destacado a nivel nacional e internacional en el estudio de las ciencias sociales. Una de sus preocupaciones ha sido formar especialistas que atiendan problemáticas sociales desde la perspectiva territorial. Por tal motivo, en 1985 se creó la Maestría en Estudios Regionales.

La Maestría está inscrita en el Sistema Nacional de Posgrados​ del Consejo Nacional de Humanidades Ciencias y Tecnologías (CONAHCYT)​. Esto certifica su nivel de excelencia, a la vez que les permite a sus estudiantes contar con una beca de manutención, de manera que puedan dedicarse de tiempo completo a sus estudios.​

 El programa de la Maestría tiene una duración de dos años, en dicho tiempo los alumnos deben presentar y defender una tesis que sea producto de una investigación original. Para cumplir con dicha tarea, los estudiantes cuentan con el apoyo de profesores-investigadores de primer nivel, que en su mayoría cuentan con estudios de doctorado y son miembros del Sistema Nacional de Investigadores.