El Instituto de Investigaciones Dr. José María Luis Mora fue creado por decreto presidencial el 24 de septiembre de 1981. El 11 de octubre de 2006 fue reestructurado como un organismo público descentralizado de la Administración Pública Federal y forma parte del Sistema de Centros Públicos de la Secretaría de Ciencia, Humanidades, Tecnología e Innovación (SECIHTI).

El Instituto Mora se ha especializado en historia, ciencias sociales y cooperación internacional para el desarrollo.

Cuenta actualmente con siete programas docentes: una licenciatura, cuatro maestrías y dos doctorados. Además de ofertas de formación por la vía de Educación Continua.

También es una Entidad de Certificación de Competencias Laborales y tiene dos laboratorios y cuatro áreas de apoyo: biblioteca, publicaciones, informática y la unidad de innovación educativa.