Realizar y fomentar actividades de Investigación científica y de formación especializada de capital humano en el campo de la historia, las
ciencias sociales y la cooperación Internacional, así como difundir los resultados de sus investigaciones. Como integrante del Sistema de Centros Públicos CONACYT, al apoyar la Investigación científica de calidad e impulsar la formación de Recursos Humanos de alto nivel, el Instituto Mora cumple la parte que le corresponde en el fomento al desarrollo del país, que es la misión del Programa Especial de Ciencia y Tecnología (PECYT).
Visión:
Concebimos el futuro del Mora en el mediano plazo, como la consolidación de una de las Instituciones más Importantes de Investigación, docencia y difusión de la historia, las ciencias sociales y la cooperación internacional en México; punto necesario de referencia para los interesados en el acontecer del México moderno y contemporáneo, así como en el pasado y presente de las naciones del continente americano, vistas de nuestra perspectiva nacional .